Os projetos finalistas são julgados por videoconferências, considerando a capacidade criativa e pensamento científico dos estudantes, além do rigor, competência e clareza demonstrada em seus projetos. O júri é composto de cerca de mil especialistas, de diversas áreas, todos com doutorado ou formação equivalente e experiência relevante na área, além de ganhadores de prêmios importantes, inclusive de Prêmio Nobel.
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Os quatro primeiros colocados, em cada categoria, receberão de US$ 3.000 a US$ 500 como prêmios. Entre eles sairá o grande vencedor da feira, que ganhará US$ 75 mil. Os segundos melhores colocados receberão US$ 50 mil cada um. Além dos valores dessas categorias, aproximadamente US$ 4 milhões serão concedidos como prêmios de reconhecimento por patrocinadores da feira, na forma de bolsas de estudo, estágios de verão, viagens científicas e equipamentos de laboratório.